Навигация

Порядок изготовления модели т-РНК из бисера

Главная
Об авторе
     Урочное:
Биология + компьютер:
         полные уроки по типам
Компьютерные программы
         на уроках
 Биософт                 Планшет
 Учебные рисунки и
           карикатуры
 Фотографии           Проекты
 Художественная
         литература на уроке
 Наглядные пособия, игры
 Олимпиадное
 Книги и статьи
 ''Биология-10'':
         попытка учебника
 ''Игра и биология''
 ''Информационная
       культура и/или компьютер
       на уроках биологии''
 ИУМК ''Экология.          Конструирование
         биосферы''
 Проектно-ролевая игра
         ''Генная инженерия''
 ''Библейская генетика''
 Рабочие тетради
         по общей биологии
 Педагогическое
 Блог

Чтобы сделать модель т-РНК из бисера, берем проволоку для бисера (лучше именно проволоку, а не леску - она позволит лучше держать форму, понадобится 1,2-1,5 м) и крупный бисер 6 цветов: 4 для азотистых оснований, черный для обозначения сахара и оранжевый - для фосфатных групп. Цветовые обозначения берем из инструкции для аналогичной модели ДНК (урацил того же цвета, что и тимин). Также понадобится 15-20 маленьких бисерин для азотистых оснований, не образующих комплементарных пар.
Находим хороший рисунок т-РНК: в нашем случае это фенилаланиновая т-РНК дрожжей, удобно, что для нее есть и модель 4tna (см. на соответствующей странице PDB) - это позволит уточнить минорные (нетипичные) основания.

На рисунке можно сразу отметить цветными фломастерами или ручками цвет и количество бисерин; это заметно упростит нанизывание. 
Начинаем с антикодоновой петли. Блоки "сахар-азотистое основание-концевая бисерина" идут аппендиксами и разделяются фосфатными бисеринами (для трех оснований антикодона можно выбрать особые концевые бисерины, см. фото).
Шпильку из 5 пар комплементарных нуклеотидов делаем по  инструкции для ДНК.
Переходим к правой, ТΨС-петле. Азотистые основания и сахаро-фосфатный остов нанизываем последовательно змейкой на один конец проволоки (см. эскиз слева).
Когда все 5 пар нуклеотидов шпильки заготовлены, собираем аппендиксами свободные непарные нуклеотиды.
Возвратным ходом проволоки (не забывая добавлять по оранжевому фосфату) собираем пары нуклеотидов.
Аналогично выполняем D-петлю.
Последовательно обратным ходом проволоки собираем комплементарные пары нуклеотидов в "лесенку".
Так получается еще одна шпилька.
Акцепторный участок также собирается полностью аналогично ДНК. После завершения сборки цепи нуклеотидов на 3´-конце добавляем (через фосфат) аминокислоту (фенилаланин) в виде крупной чёрной бусины.

Получается весьма эффектная и достаточно жёсткая конструкция.

Теперь стоит попробовать сложить трехмерную ("третичную") структуру т-РНК в виде буквы "Г". Для этого также стоит воспользоваться моделью фенилаланиновой т-РНК дрожжей 4tna (или см. на соответствующей странице PDB).

Успехов!