12-битовый идентификатор кластера, используемый в FAT12 ограничивает раздел диска хранением максимум 212 (4096) в кластерах. Windows 2000 использует размеры кластера от 512 байтов до 8 КБ по величине, которые ограничивают размер тома FAT12 до 32 МБ. Поэтому, Windows 2000 использует FAT12 как формат для всех 5¼-дюймовых и 3.5-дюймовых дискет, которое сохраняют до 1.44 МБ данных.
FAT16, с 16-разрядным идентификатором кластера, может обратиться к 216 (65 536) кластерам. В Windows 2000, размеры кластера располагаются в диапазоне от 512 байтов до 64 КБ, которые ограничивают размер тома до 4 Гбайт. Использование размера кластера Windows 2000 зависят от размера тома. Если Вы форматируете том, который является меньше чем 16 МБ, как в файловой системе FAT, используйте команду format или оснастку Диспетчер дисков (Disk Management), то Windows 2000 использует формат FAT12 вместо FAT32.
Таблица ниже содержит значение размеры кластера по умолчанию в FAT16.
| Размер тома | Размер кластера |
|---|---|
| 0 до 32 Mб | 512 байтов |
| 33 до 64 Mб | 1 Kб |
| 65 до128 Mб | 2 Kб |
| 129 до 256 Mб | 4 Kб |
| 257 до 511 Mб | 8 Kб |
| 512 до 1023 Mб | 16 Kб |
| 1024 до 2047 Mб | 32 Kб |
| 2048 до 4095 Mб | 64 Kб |
Файловая система FAT дает возможность составлять имена файла до 255 символов, включая символ завершения строки ('0'). Это похоже на NTFS, который разрешает имена файлов до 256 символов. Файловая система FAT также дает возможность составлять пути до 260 символов, включая символ завершения строки ('0').